在地球以外的其他星球，人们把自己所在的星球称为“大空陆”。那里的人类一出生就必须以“女性”的身份生活。等到17岁的时候，到“泉”那里，选择性别而成为"大人"。r为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎“ヘリカル.モートリス ”(海螺引擎)，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。并且派遣未性别化的“巫女”担任驾驶员，于是，她们成为了被称为Simoun小队的战斗小队成员。r操纵“Simoun”的少数少女被称

在日本一条名为“霞之里”的宁静小村庄里，那里远离人烟，但却有一所女校在这里。原来这所学校叫“私立志能备学园”，是一所负责女忍者训练的精英学院，是全日本,甚至全世界唯一一所的女忍者训练学校。而其实在“霞之里”生活的居民中很多都是这所学校的毕业生，学院中的学生大多为被赋予高智商高天分的有极其优秀基因的试管婴儿，所以都拥有极其高的天分。事实上从这里毕业的忍者，进入社会后都会当上保护重要人物或替国家和机构进行各种调查和探取情报的间谍工作，可说是一种既刺激又好玩又有前途的职业。但此学校只是女忍学校，与霞之里的另一所